Do terapii stosuje się fale ciągłe lub impulsowe emitowane w określonym czasie, o odpowiedniej mocy mierzonej w watach nazywanych mocą akustyczną. Jednym z najistotniejszych efektów towarzyszących oddziaływaniu fali drgań na organizm jest wywołane przez nią ciśnienie. Wahania ciśnienia są główną składową mechanizmu leczniczego działania ultradźwiękami. Efekt ten nazywa się mikromasażem tkanek. Ponadto ultradźwięki dają efekt cieplny (największy w tkance nerwowej i na granicy zmian struktur tkankowych) oraz fizykochemiczny.
Najważniejsze, wykorzystywane klinicznie efekty działania ultradźwięków to pobudzenie regeneracji tkanek, zmniejszenie napięcia mięśni czego efektem jest działanie przeciwbólowe, zwiększenie elastyczności tkanki łącznej (przy bliznach przykurczach, zwłóknieniach mięśni i torebek stawowych), przyspieszenie gojenia się ran (tkanek miękkich i tkanki kostnej), zwiększenie ruchomości stawów, poprawa mikrokrążenia.